RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GPR162Q16538 588 aa36.34■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 CHD1LQ86WJ1 897 aa36.34■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 LNPKQ9C0E8 428 aa36.34■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 KLRK1P26718 216 aa36.34■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 NFKBIEO00221 500 aa36.33■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 SUPT20HQ8NEM7 779 aa36.33■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
ECHS1-201ENST00000368547 TAOK3Q9H2K8 898 aa36.32■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.31■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 ADORA1P30542 326 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 TXNRD3Q86VQ6 643 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 XAGE2Q96GT9 111 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 EYA3Q99504 573 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 IRS2Q9Y4H2 1338 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 MED23Q9ULK4 1368 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 WASHC4Q2M389 1173 aa36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 RIMBP2O15034 1052 aa36.29■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 DBNDD2Q9BQY9 259 aa36.29■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 LTBP3Q9NS15 1303 aa36.28■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 RASSF7Q02833 373 aa36.27■■■■□ 3.4
ECHS1-201ENST00000368547 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
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ECHS1-201ENST00000368547 UTRNP46939 3433 aa36.25■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 AOC3Q16853 763 aa36.25■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 GORABQ5T7V8 394 aa36.25■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa36.25■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 CAVIN4Q5BKX8 364 aa36.24■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 PPIP5K2O43314 1243 aa36.23■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA2012Q0VF49 1180 aa36.23■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 BCAMP50895 628 aa36.23■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 GRIN3BO60391 1043 aa36.22■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 IARSP41252 1262 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 VPS33BQ9H267 617 aa36.22■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC102BQ68D86 513 aa36.21■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF804AQ7Z570 1209 aa36.21■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO33Q7Z6M2 555 aa36.21■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 VPS37DQ86XT2 251 aa36.21■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 SBF1O95248 1867 aa36.21■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 PHKA1P46020 1223 aa36.2■■■■□ 3.39
ECHS1-201ENST00000368547 PDE4AP27815 886 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 PRELPP51888 382 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 SALL3Q9BXA9 1300 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 DOK7Q18PE1 504 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC158Q5M9N0 1113 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 LARGE2Q8N3Y3 721 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 COL4A5P29400 1685 aa36.18■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 G3V3G9 751 aa36.17■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 MX1P20591 662 aa36.17■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF8Q5TAQ9 597 aa36.17■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 SKAP1Q86WV1 359 aa36.17■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 COA1Q9GZY4 146 aa36.16■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 DBNDD1Q9H9R9 158 aa36.16■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 TTC39AQ5SRH9 613 aa36.16■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 GPATCH3Q96I76 525 aa36.16■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 CD209Q9NNX6 404 aa36.16■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 MYH13Q9UKX3 1938 aa36.15■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 TSHZ3Q63HK5 1081 aa36.15■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 ECHDC1Q9NTX5 307 aa36.15■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 CHD4Q14839 1912 aa36.14■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 LMNB1P20700 586 aa36.14■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa36.13■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 ECE2O60344 883 aa36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 PDE1AP54750 535 aa36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 TTC41PQ6P2S7 1318 aa36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 IL1R1P14778 569 aa36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 NIM1KQ8IY84 436 aa36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 STAP2Q9UGK3 403 aa36.12■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.11■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa36.11■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 JDP2Q8WYK2 163 aa36.11■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 PODNQ7Z5L7 613 aa36.1■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 SCARF1Q14162 830 aa36.09■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 AKAP11Q9UKA4 1901 aa36.09■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 SCN9AQ15858 1988 aa36.08■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 ATP5JP18859 108 aa36.08■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 RGS3P49796 1198 aa36.08■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 RASGRF1Q13972 1273 aa36.08■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 MCAMP43121 646 aa36.08■■■■□ 3.37
ECHS1-201ENST00000368547 PI4K2BQ8TCG2 481 aa36.07■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 ZNRF3Q9ULT6 936 aa36.07■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 YDJCA8MPS7 323 aa36.06■■■■□ 3.36
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