RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 LRP5O75197 1615 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 NTSR2O95665 410 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 UVSSAQ2YD98 709 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-204ENST00000352260 CHGBP05060 677 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TTC14Q96N46 770 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 PHF14O94880 888 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CUL4AQ13619 759 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 ATP2B3Q16720 1220 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 GORABQ5T7V8 394 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SPEF2Q9C093 1822 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TAF5LO75529 589 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 KCNJ4P48050 445 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TICAM2Q86XR7 235 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 LAMB2P55268 1798 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SLC27A2O14975 620 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC12Q96J65 1359 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM37O94972 964 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 TSPY26PQ9H489 355 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SCN7AQ01118 1682 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SYCE3A1L190 88 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC125Q86Z20 511 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 RPS6KA4O75676 772 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 PDE8BO95263 885 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CPA1P15085 419 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 AK2P54819 239 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SMIM5Q71RC9 77 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 RTL9Q8NET4 1388 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-204ENST00000352260 RGL2O15211 777 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 SCARF1Q14162 830 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 RNF20Q5VTR2 975 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 KIF20AO95235 890 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 SBF2Q86WG5 1849 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 PKP1Q13835 747 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 LY75O60449 1722 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 VPS53Q5VIR6 699 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 RUFY3Q7L099 469 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 ZAP70P43403 619 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 NARFQ9UHQ1 456 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.129e-11■□□□□ 10.8
SPNS1-204ENST00000352260 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 GNPATO15228 680 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 BRD1O95696 1058 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 FGFR2P21802 821 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 ERFEQ4G0M1 354 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 PSMA5P28066 241 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.04■■□□□ 1.12
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