RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 FANCLQ9NW38 375 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3-202ENST00000327307 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RRN3-202ENST00000327307 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3-202ENST00000327307 KIF27Q86VH2 1401 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3-202ENST00000327307 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3-202ENST00000327307 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CPLX1O14810 134 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 EPHB1P54762 984 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 BPIFB3P59826 476 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 VAC14Q08AM6 782 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SERINC3Q13530 473 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 OR8H2Q8N162 312 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ARL10Q8N8L6 244 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 FAM170AA1A519 330 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 FGRP09769 529 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PDE4AP27815 886 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ZNF76P36508 570 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 UBA7P41226 1012 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 COX10Q12887 443 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 FEZ1Q99689 392 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 DIP2BQ9P265 1576 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 KIAA0754O94854 1291 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 HIC1Q14526 733 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 JAMLQ86YT9 394 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 EPB42P16452 691 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 MASP1P48740 699 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 COPAP53621 1224 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 UBXN2AP68543 259 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 KIF2CQ99661 725 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 MED4Q9NPJ6 270 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CUL7Q14999 1698 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SNX2O60749 519 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PPFIA2O75334 1257 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 RHOBTB3O94955 611 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 OATP04181 439 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 GLULP15104 373 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 GSDMAQ96QA5 445 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 VPS33BQ9H267 617 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 H3BRB1 525 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 VCAM1P19320 739 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CLCN1P35523 988 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 PIP5K1CO60331 668 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CAPN2P17655 700 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 UBASH3AP57075 661 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 CHMP4BP1P59074 171 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
RRN3-202ENST00000327307 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms