RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 CHD1O14646 1710 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 JAG2Q9Y219 1238 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 MBD4O95243 580 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 GSDMDP57764 484 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 KANK3Q6NY19 840 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 XAGE2Q96GT9 111 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 NEMFO60524 1076 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 GNAT2P19087 354 aa18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 PHKG2P15735 406 aa18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 SKIDA1Q1XH10 827 aa18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 RPS6KB1P23443 525 aa18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.6■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 CALML4Q96GE6 196 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 ERLIN1O75477 346 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 AFMP43652 599 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 PDE8AO60658 829 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 APPBP2Q92624 585 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 GNPATO15228 680 aa18.58■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.58■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 CUL5Q93034 780 aa18.58■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 ATP7BP35670 1465 aa18.58■□□□□ 0.57
EHD3-201ENST00000322054 GNAQP50148 359 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TYRO3Q06418 890 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PARP10Q53GL7 1025 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 BEND3Q5T5X7 828 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TSG101Q99816 390 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 FEZ1Q99689 392 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CABP5Q9NP86 173 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 MYO6Q9UM54 1294 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TRIM75PA6NK02 468 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 BMP15O95972 392 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 SPA17Q15506 151 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 B4E1Z4 1266 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 GPAA1O43292 621 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 HSPA4P34932 840 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 USP6P35125 1406 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 KIF5CO60282 957 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TNIP1Q15025 636 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 AMPD3Q01432 767 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PICALMQ13492 652 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 KIF1BO60333 1816 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TAF5LO75529 589 aa18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ZNF853P0CG23 659 aa18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 UBASH3AP57075 661 aa18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TCIRG1Q13488 830 aa18.55■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 N4BP3O15049 544 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ATP5JP18859 108 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 PROSER3Q2NL68 480 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.54■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 KIF20AO95235 890 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 YEATS4O95619 227 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 ABCC3O15438 1527 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TMEM94Q12767 1356 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 NLRP1Q9C000 1473 aa18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
EHD3-201ENST00000322054 BRAPQ7Z569 592 aa18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms