RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.66■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 OTOFQ9HC10 1997 aa21.65■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 WNT10BO00744 389 aa21.65■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 PRKG1Q13976 671 aa21.65■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L3A6NCW0 530 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L4A6NCW7 530 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 CRHR2Q13324 411 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 FAM89AQ96GI7 184 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 GGA1Q9UJY5 639 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.64■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.63■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.63■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SPEF2Q9C093 1822 aa21.62■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 WNK4Q96J92 1243 aa21.62■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 PRO3102Q9H379 93 aa21.62■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.62■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 FZD1Q9UP38 647 aa21.62■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.61■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SP3Q02447 781 aa21.6■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K11Q16584 847 aa21.6■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.6■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 PODNQ7Z5L7 613 aa21.6■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SASH1O94885 1247 aa21.59■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.59■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.59■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.59■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.59■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.58■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 DACT2Q5SW24 774 aa21.58■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.58■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 MXD3Q9BW11 206 aa21.58■■□□□ 1.05
SPCS1-201ENST00000233025 NFE2L2Q16236 605 aa21.57■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF11Q86T75 865 aa21.57■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 XDHP47989 1333 aa21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R1AP30153 589 aa21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 OGFOD1Q8N543 542 aa21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN18Q99952 460 aa21.56■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 GJA5P36382 358 aa21.55■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MYH3P11055 1940 aa21.55■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.55■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MED23Q9ULK4 1368 aa21.54■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.54■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.54■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.54■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 SHISA4Q96DD7 197 aa21.54■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 UNCXA6NJT0 531 aa21.52■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 NEFMP07197 916 aa21.52■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MMP14P50281 582 aa21.52■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPCS1-201ENST00000233025 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 ATP2B4P23634 1241 aa21.51■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.51■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.51■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.5■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.5■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 DPF3Q92784 378 aa21.5■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.5■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.49■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 VCANP13611 3396 aa21.48■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF6Q15052 776 aa21.48■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.48■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 ALPK3Q96L96 1907 aa21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPC1 479 aa21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW7Q969H0 707 aa21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 LRCH3Q96II8 777 aa21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.47■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.46■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.46■■□□□ 1.03
SPCS1-201ENST00000233025 KRT24Q2M2I5 525 aa21.45■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.45■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.45■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.44■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 COA1Q9GZY4 146 aa21.44■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 MTFR1Q15390 333 aa21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.43■■□□□ 1.02
SPCS1-201ENST00000233025 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.43■■□□□ 1.02
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