RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 ATP1A3P13637 1013 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 MTX1Q13505 466 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 LONRF3Q496Y0 759 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 BEND3Q5T5X7 828 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 HINFPQ9BQA5 517 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 ALG1Q9BT22 464 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 FLT4P35916 1363 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 SMARCE1Q969G3 411 aa20.34■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.33■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 CENPHQ9H3R5 247 aa20.33■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.33■□□□□ 0.85
SIRT1-201ENST00000212015 MAP3K5Q99683 1374 aa20.33■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF827Q17R98 1081 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PRC1O43663 620 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 HOXC9P31274 260 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ZSCAN26Q16670 478 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CYP21A2P08686 494 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CLIC4Q9Y696 253 aa20.32■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PNOCQ13519 176 aa20.31■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.31■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.31■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.31■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 IQGAP1P46940 1657 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 MYL5Q02045 173 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 MYL10Q9BUA6 226 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 DEF6Q9H4E7 631 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ALDH1L1O75891 902 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 TAF5LO75529 589 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA1Q92805 767 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PHKBQ93100 1093 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ELP1O95163 1332 aa20.3■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CEP152O94986 1710 aa20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.29■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CABP4P57796 275 aa20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 KIF1BO60333 1816 aa20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 DACH1Q9UI36 760 aa20.28■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 CLIC6Q96NY7 704 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 FANCLQ9NW38 375 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 RESTQ13127 1097 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 TNNI3KQ59H18 835 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 KIAA1328Q86T90 577 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.27■□□□□ 0.84
SIRT1-201ENST00000212015 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 SASH1O94885 1247 aa20.27■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.27■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.27■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 NBPF4Q96M43 638 aa20.27■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 DRC1Q96MC2 740 aa20.27■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 SLFN14P0C7P3 912 aa20.26■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 ANO1Q5XXA6 986 aa20.26■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 STAMQ92783 540 aa20.26■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 CDKL5O76039 1030 aa20.26■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 COBLO75128 1261 aa20.26■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 PFKFB1P16118 471 aa20.26■□□□□ 0.83
SIRT1-201ENST00000212015 FAM107BQ9H098 131 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms