RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 LPIN2Q92539 896 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 CNKSR1Q969H4 720 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 KCNJ4P48050 445 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 TGFB2P61812 414 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 SCARF1Q14162 830 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 GORABQ5T7V8 394 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 PI16Q6UXB8 463 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 STAP2Q9UGK3 403 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 UFL1O94874 794 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 SLC5A1P13866 664 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 SNRKQ9NRH2 765 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 TTC22Q5TAA0 569 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 XDHP47989 1333 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 C6orf229H3BNL8 230 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 PIM2Q9P1W9 311 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 RIMBP2O15034 1052 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 UBE4AQ14139 1066 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC102BQ68D86 513 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 MPNDQ8N594 471 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.7■■□□□ 1.23
PRRT1-201ENST00000211413 GGA1Q9UJY5 639 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 BCS1LQ9Y276 419 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 RILPL2Q969X0 211 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 LTBP1Q14766 1721 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 SDSP20132 328 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 JAG2Q9Y219 1238 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 MCAMP43121 646 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 SYT17Q9BSW7 474 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 CHGBP05060 677 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 GPATCH3Q96I76 525 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ATP5JP18859 108 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ATP2B4P23634 1241 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TMC4Q7Z404 712 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ZAP70P43403 619 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-201ENST00000211413 ERC2O15083 957 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 RASGRF1Q13972 1273 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 DOK7Q18PE1 504 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 VPS37DQ86XT2 251 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SNED1Q8TER0 1413 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 GOLIM4O00461 696 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 AOX1Q06278 1338 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CHD4Q14839 1912 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 HAUS7Q99871 368 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 AOC3Q16853 763 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 WASHC4Q2M389 1173 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC93Q567U6 631 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 AK9Q5TCS8 1911 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA5Q8NB90 893 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 CD209Q9NNX6 404 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SLC4A3P48751 1232 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 RASSF7Q02833 373 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-201ENST00000211413 SEC24BO95487 1268 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms