RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040222.13

Crocc-201, Transcript of Rootletin, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Crocc, Length 6,248 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc-201ENSMUST00000040222 Tmco5aQ9D9D5 303 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 A0A1W2P7S8 802 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ccdc191J3QQ27 883 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Spata18Q0P557 537 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Pla2r1Q62028 1487 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Stx1aO35526 288 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 SympkQ80X82 1284 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 InhbeO08717 350 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Prim1P20664 417 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Paxbp1P58501 919 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gm21985Q6P6P5 1106 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Zkscan8Q8BSL0 588 aa20.46■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Vamp4O70480 141 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Usp37Q8C0R0 979 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Krt23Q99PS0 422 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Kdm8Q9CXT6 414 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 LratQ9JI60 231 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 NmiO35309 314 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Dapk3O54784 448 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Stat1P42225 749 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Calml4Q91WQ9 153 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Smc1bQ920F6 1248 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ppfibp2O35711 882 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 GnaqP21279 359 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Hmg20bQ9Z104 317 aa20.45■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Uchl5Q9WUP7 329 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Arl1P61211 181 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Zbtb45Q52KG4 520 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Tnip1Q9WUU8 647 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ccdc112A0AUP1 442 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ccdc93Q7TQK5 629 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 RbsnQ80Y56 783 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Aldh8a1Q8BH00 487 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Slc18a1Q8R090 521 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Snapc4Q8BP86 1333 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 RragbQ6NTA4 374 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Pdcl2Q78Y63 240 aa20.44■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Krt15Q61414 452 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cd248Q91V98 765 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Tdo2P48776 406 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Atp8b2P98199 1209 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Pim2Q62070 370 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Med10Q9CXU0 135 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 DmtnQ9WV69 405 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cd274Q9EP73 290 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Speer3W4VSP1 261 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ift122Q6NWV3 1182 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cep135Q6P5D4 1140 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Vps36Q91XD6 386 aa20.43■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Csrnp1P59054 583 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Sass6Q80UK7 654 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Asic1Q6NXK8 526 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 MarcksP26645 309 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gse1Q3U3C9 1213 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Disp1Q3TDN0 1521 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Nfil3O08750 462 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Abcc1O35379 1528 aa20.42■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Lrrc36Q3V0M2 755 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 MaeaQ4VC33 396 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Fndc3aQ8BX90 1198 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Vps18Q8R307 973 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Sbno1Q689Z5 1390 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Fyb2A2A995 729 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 CalcaP70160 136 aa20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Olfm5Q8BU90 496 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rab3il1Q8VDV3 383 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Smim5Q8BT42 78 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Mtmr3Q8K296 1196 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Bloc1s4Q8VED2 215 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Krt20Q9D312 431 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cfap73J3QPZ5 306 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 F2rP30558 430 aa20.4■□□□□ 0.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Tldc2A2ACG1 198 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gm38392E9Q2A2 434 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cfap52Q5F201 620 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Bbof1Q3V079 533 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ankrd40Q5SUE8 363 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Srgap1Q91Z69 1062 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 NpatQ8BMA5 1420 aa20.39■□□□□ 0.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25 ms