RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ttll7A4Q9F0 912 aa15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Wdr24Q8CFJ9 790 aa15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Homer1Q9Z2Y3 366 aa15.9■□□□□ 0.14
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ugt1a5B2RT14 529 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sun3Q5SS91 320 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Appbp2Q9DAX9 585 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc1a4O35874 532 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ncoa4Q5U4H9 625 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hspa4Q61316 841 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rtn1Q8K0T0 780 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Grpel1Q99LP6 217 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc94Q9D6J3 314 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc191J3QQ27 883 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Clec11aO88200 328 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hspa2P17156 633 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Smarcc1P97496 1104 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Myo1bP46735 1107 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ncaph2Q8BSP2 607 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 IntuQ059U7 942 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nlrp9aQ66X03 949 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atp10aO54827 1508 aa15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc93Q7TQK5 629 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Neurl4Q5NCX5 1563 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mast3Q3U214 1321 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Abca6Q8K441 1624 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bach2P97303 839 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Jakmip3Q5DTN8 844 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Itga6Q61739 1091 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Letm1Q9Z2I0 738 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Map9Q3TRR0 646 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 DbnlQ62418 436 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kcna6Q61923 529 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Miga2Q8BK03 593 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Frat1P70339 274 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Spg7Q3ULF4 781 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm12185Q5NCB2 835 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hecw1Q8K4P8 1604 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm9992B2RWK3 458 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm7347D3YYI9 267 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Speer4aF8VPX6 267 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Unc93aQ710D3 458 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kif2cQ922S8 721 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Osbpl5Q9ER64 874 aa15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rnf187Q8BFX1 236 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 DlatQ8BMF4 642 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tpcn2Q8BWC0 731 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem119Q8R138 280 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 MycbpapQ5SUV2 932 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 RragbQ6NTA4 374 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CpvlQ9D3S9 478 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Col1a2Q01149 1372 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 IqcgQ80W32 419 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Abcc4E9Q236 1325 aa15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mcm6P97311 821 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pex1Q5BL07 1284 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ift88Q61371 824 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dctn1O08788 1281 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Usp5P56399 858 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Morc2aQ69ZX6 1030 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zfyve16Q80U44 1528 aa15.84■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ftl2P49945 183 aa15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Themis2Q91YX0 663 aa15.83■□□□□ 0.13
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ptgs1P22437 602 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Vps37dQ810I0 261 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zfp251Q6PCX8 632 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc181Q80ZU5 509 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Olfm5Q8BU90 496 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Uchl5Q9WUP7 329 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Oas2E9Q9A9 742 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm28047Q3US59 414 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc122Q8BVN0 290 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cadps2Q8BYR5 1297 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf287Q9EQB9 759 aa15.83■□□□□ 0.12
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dmrt2Q8BG36 561 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.6 ms