RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 ECH1Q13011 328 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SPHARQ15513 63 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 NEDD8Q15843 81 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 GABRA6Q16445 453 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 GSG1Q2KHT4 349 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATC1Q76KD6 591 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SYS1Q8N2H4 156 aa9.91□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HPS1Q92902 700 aa9.91□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 C4orf36Q96KX1 117 aa9.91□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 LY6HO94772 140 aa9.9□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 PSMB9P28065 219 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 HTR5AP47898 357 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB1AP62820 205 aa9.9□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CDONQ4KMG0 1287 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 TP53I3Q53FA7 332 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.9□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SSX8Q7RTT4 187 aa9.9□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 FBXO17Q96EF6 278 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.9□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 SYT3Q9BQG1 590 aa9.9□□□□□ -0.82
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR5H1A6NKK0 313 aa9.89□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC6A9P48067 706 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 OR12D2P58182 307 aa9.89□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 PSG4Q00888 419 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 GALK2Q01415 458 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 ROM1Q03395 351 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 TSC22D1Q15714 1073 aa9.89□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 TEX29Q8N6K0 151 aa9.89□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.89□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 UFD1Q92890 307 aa9.89□□□□□ -0.83
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CAPNS1-209ENST00000590049 COQ7Q99807 217 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10A4Q9H209 315 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-209ENST00000590049 SP140LQ9H930 580 aa9.89□□□□□ -0.83
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