RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	OR10A2	Q9H208	303 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A087WXM4	84 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	P2RY10	O00398	339 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	TBX1	O43435	398 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	XRCC2	O43543	280 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	CLPTM1	O96005	669 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	ISG15	P05161	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	OR4A8	P0C604	315 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	DANCR	P0C864	163 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	KRTAP10-9	P60411	292 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM3A	P98173	230 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	PSG7	Q13046	419 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	MED22	Q15528	200 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	RGCC	Q9H4X1	137 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	CACNA1D	Q01668	2161 aa		10.77	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.77	□□□□□ -0.68
DNMT1-208	ENST00000586667	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM212	A6NML5	194 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	PLPP2	O43688	288 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	LMX1B	O60663	402 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SOD3	P08294	240 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	RAC2	P15153	192 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ATP6V1B1	P15313	513 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	KITLG	P21583	273 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ACHE	P22303	614 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TUBG1	P23258	451 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	GSK3A	P49840	483 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TAS2R43	P59537	309 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TPBG	Q13641	420 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	EFNB3	Q15768	340 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	NEDD8	Q15843	81 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TIGD6	Q17RP2	521 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	FCGR1B	Q92637	280 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	MGLL	Q99685	303 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	OPA3	Q9H6K4	179 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SP140L	Q9H930	580 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	PDZD2	O15018	2839 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667		H3BSH0	61 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	CD8A	P01732	235 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	CD1A	P06126	327 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	CPE	P16870	476 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	CEL	P19835	753 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TTK	P33981	857 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	TGFBR2	P37173	567 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	LIPA	P38571	399 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	FABP6	P51161	128 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	MMP15	P51511	669 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	MALL	Q13021	153 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DNMT1-208	ENST00000586667	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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