RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 NOX4Q9NPH5 578 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 H0YAE9 185 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 DLGAP1O14490 977 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 MLNRO43193 412 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 NDUFA2O43678 99 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TXNDC12O95881 172 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PLATP00750 562 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 HLA-DPB1P04440 258 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RAP2AP10114 183 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF823P16415 610 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 FUT4P22083 530 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 GATA4P43694 442 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 ALDH3B2P48448 385 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 HIST1H3AP68431 136 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 MZT1Q08AG7 82 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 COX10Q12887 443 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 GK3PQ14409 553 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OR8G1Q15617 311 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 MEP1BQ16820 701 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 CORO6Q6QEF8 472 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 SATL1Q86VE3 508 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OR52J3Q8NH60 311 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 SPTSSAQ969W0 71 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TECTBQ96PL2 329 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 ATF6BQ99941 703 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 ADI1Q9BV57 179 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 IFT27Q9BW83 186 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 CHID1Q9BWS9 393 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 WDR76Q9H967 626 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RNF7Q9UBF6 113 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 B9D1Q9UPM9 204 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 LHFPL6Q9Y693 200 aa9.91□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 SRRM5B3KS81 715 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 KCNAB3O43448 404 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 IDH3BO43837 385 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 GMDSO60547 372 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 GADD45GO95257 159 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PPP1R3DO95685 299 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 NCK1P16333 377 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OMGP23515 440 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 GGT2P36268 569 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 CAPGP40121 348 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OMPP47874 163 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 FGF12P61328 243 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 DEFA6Q01524 100 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PAX2Q02962 417 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 LSAMPQ13449 338 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OR8B8Q15620 311 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RFX4Q33E94 735 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 FANK1Q8TC84 345 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RDH12Q96NR8 316 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TSSK2Q96PF2 358 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 NMNAT3Q96T66 252 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.9□□□□□ -0.82
DDX39B-210ENST00000431908 A0A087WXM4 84 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 GGT3PA6NGU5 568 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 P2RY10O00398 339 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 ARPC3O15145 178 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 OR10H3O60404 316 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 FAM20BO75063 409 aa9.89□□□□□ -0.83
DDX39B-210ENST00000431908 TOX4O94842 621 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms