RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD80P33681 288 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNB2P62879 340 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAX8Q06710 450 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AWAT1Q58HT5 328 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM246Q9BRR3 403 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNG2Q9UJ96 466 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSTL3O95633 263 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF2P14316 349 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPTEP56180 551 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGBD2Q6P3X8 592 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTNL3Q6UXE8 466 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAA40Q86UY6 237 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO4A1Q96BD0 722 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP8B1O43520 1251 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF823P16415 610 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRTN3P24158 256 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMELP40967 661 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GATA4P43694 442 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAX2Q02962 417 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF404Q494X3 552 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRN1Q6UXK5 716 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGAP1Q75T13 922 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGMS2Q8NHU3 365 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP6Q96JE9 813 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EGLN3Q9H6Z9 239 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.91■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT36O76013 467 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAMBIQ13145 260 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAB21L1Q13394 359 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM201AQ5SY85 155 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRC3Q7RTR2 1065 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8B3Q8NGG8 313 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR11L1Q8NGX0 322 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB40AQ8WXH6 277 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTSSAQ969W0 71 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERGIC1Q969X5 290 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUX5Q96PT3 197 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8B2Q96RD0 313 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R135 149 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIAL4GP0DN37 164 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HKR1P10072 659 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYCR1P32322 319 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD200P41217 278 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXL1Q12952 345 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATS1Q496A3 300 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf89Q6UX73 402 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP8Q8N3A8 854 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB561A3Q8NBI2 242 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROKR2Q8NFJ6 384 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF799Q96GE5 643 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDE1Q9NXR1 346 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EGR1P18146 543 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITPNBP48739 271 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGA2P52926 109 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MXRA7P84157 204 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00471Q8N535 108 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2T4Q8NH00 348 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8TCH9 128 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TVP23AA6NH52 213 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF11BO00300 401 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHLHE40O14503 412 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM20BO75063 409 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS27P42677 84 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD23AP54725 363 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8G1Q15617 311 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCDC5Q6ZRR9 648 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10S1Q8NGN2 331 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UPRTQ96BW1 309 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDOQ99489 341 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.3 ms