RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427516.2

VTI1BP4-201, Transcript of vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B pseudogene 4, humanhuman

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Gene VTI1BP4, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BP4-201ENST00000427516 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 A0A1B0GV72 72 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 XKRY2A2RUG3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 GJE1A6NN92 205 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 IQCF5A8MTL0 148 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 XKRYO14609 159 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 AGPAT2O15120 278 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 YY2O15391 372 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 KCNAB3O43448 404 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 LATO43561 262 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TNFSF13O75888 250 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TNFSF15O95150 251 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SFT2D2O95562 160 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 AMBPP02760 352 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SFTPBP07988 381 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 NPSP0C0P6 89 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ELFN1P0C7U0 828 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FGF5P12034 268 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FPR2P25090 351 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SERPINA4P29622 427 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 CHRNB4P30926 498 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 BRS3P32247 399 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 AKR1C3P42330 323 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR3A2P47893 321 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RAB7AP51149 207 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 LBX1P52954 281 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 MTCP1P56278 107 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TPPP2P59282 170 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TAS2R46P59540 309 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 PFN3P60673 137 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 S100A10P60903 97 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RHOAP61586 193 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 BTN3A2P78410 334 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 EGR3Q06889 387 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 UBE2V1Q13404 147 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 PPP1R1AQ13522 171 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 IHHQ14623 411 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SHHQ15465 462 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ODF4Q2M2E3 257 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 MAJINQ3KP22 176 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF385BQ569K4 471 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 METRNLQ641Q3 311 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FBXL22Q6P050 247 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 Q7L0L9 218 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 BIVMQ86UB2 503 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RNF175Q8N4F7 328 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF676Q8N7Q3 588 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ELOA3Q8NG57 546 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 OR8S1Q8NH09 359 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 PPTC7Q8NI37 304 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TMEM239Q8WW34 195 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 NEIL2Q969S2 332 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FAM46BQ96A09 425 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 NUDT11Q96G61 164 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 TMEM169Q96HH4 297 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 IGSF21Q96ID5 467 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 SNX22Q96L94 193 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 MCHR1Q99705 422 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ATG101Q9BSB4 218 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 VAMP8Q9BV40 100 aa5.05□□□□□ -1.6
VTI1BP4-201ENST00000427516 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.05□□□□□ -1.6
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