RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		7.17	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		7.17	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MED13L	Q71F56	2210 aa		7.17	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ZAR1L	A6NP61	321 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MPZL1	O95297	269 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	LCK	P06239	509 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	CCL2	P13500	99 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PRKACG	P22612	351 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	CCNO	P22674	350 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	IGFBP5	P24593	272 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GIF	P27352	417 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GCH1	P30793	250 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ERF	P50548	548 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MEP1B	Q16820	701 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SHF	Q7M4L6	423 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ABHD4	Q8TB40	342 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	FAM168A	Q92567	244 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MAP6	Q96JE9	813 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	TOR3A	Q9H497	397 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	OPA3	Q9H6K4	179 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	USE1	Q9NZ43	259 aa		7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128		A0A1W2PPW3	197 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PLSCR5	A0PG75	271 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	C17orf100	A8MU93	164 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ZNF878	C9JN71	531 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SSX4	O60224	188 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	NDUFS7	O75251	213 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GPANK1	O95872	356 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	APOC1	P02654	83 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ALPL	P05186	524 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	INHBB	P09529	407 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	RAC2	P15153	192 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	KITLG	P21583	273 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SLC2A5	P22732	501 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	POU1F1	P28069	291 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PYCR1	P32322	319 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SLC15A1	P46059	708 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PDLIM4	P50479	330 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MMP15	P51511	669 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	EFNB1	P98172	346 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GGTLC2	Q14390	218 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	C12orf73	Q69YU5	71 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	DRAM2	Q6UX65	266 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	GID4	Q8IVV7	300 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	TIGD4	Q8IY51	512 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ZNF786	Q8N393	782 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ST7L	Q8TDW4	575 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PTP4A1	Q93096	173 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ITFG2	Q969R8	447 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SPTSSA	Q969W0	71 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	INTS14	Q96SY0	518 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	PITX2	Q99697	317 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	CIB1	Q99828	191 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	DUSP13	Q9UII6	198 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		7.15	□□□□□ -1.26
USP34-208	ENST00000467128	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		7.15	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128		A0A096LNT2	108 aa		7.14	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128		A0A1B0GWJ7	208 aa		7.14	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		7.14	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	TRIM64B	A6NI03	449 aa		7.14	□□□□□ -1.27
USP34-208	ENST00000467128	FAM183A	A6NL82	134 aa		7.14	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms