RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF205O95201 554 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PLATP00750 562 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CST2P09228 141 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF20P17024 532 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PCGF2P35227 344 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 BTG1P62324 171 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CD47Q08722 323 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CYP51A1Q16850 503 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC80Q76M96 950 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 PARP8Q8N3A8 854 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 DPP10Q8N608 796 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 OR10A6Q8NH74 314 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 C4orf45Q96LM5 186 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SAMD8Q96LT4 415 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SLITRK2Q9H156 845 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 GID8Q9NWU2 228 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 STARD10Q9Y365 291 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC42Q9Y546 428 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-202ENST00000429017 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT19A8MXV4 375 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 H0YL77 283 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 H3BSA7 217 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 H7C1C5 153 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ANGPT2O15123 496 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FKBP6O75344 327 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 KITLGP21583 273 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 LIPAP38571 399 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PMELP40967 661 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RBM34P42696 430 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR1E2P47887 323 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 HMGA2P52926 109 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 LCN6P62502 163 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TAF11Q15544 211 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FAM201AQ5SY85 155 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf87Q6PH81 154 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SPATC1Q76KD6 591 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PGAM4Q8N0Y7 254 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SPICQ8N5J4 248 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TSPEARQ8WU66 669 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM239Q8WW34 195 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A6Q92536 515 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A28Q96A46 364 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 UPRTQ96BW1 309 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CMBLQ96DG6 245 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MRI1Q9BV20 369 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM165Q9HC07 324 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 EMC7Q9NPA0 242 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 POLE4Q9NR33 117 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFAF1Q9Y375 327 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 VWFP04275 2813 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPL8 197 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 FBP2O00757 339 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 IMPA2O14732 288 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 OR5F1O95221 314 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD16AO95870 558 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 IGF2P01344 180 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R41P59536 307 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CTXN1P60606 82 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ESCO2Q56NI9 601 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 ALG10Q5BKT4 473 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms