RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 ACHEP22303 614 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 FMO3P31513 532 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ENTPD1P49961 510 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CRISP1P54107 249 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CDK5R2Q13319 367 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 TEX30Q5JUR7 227 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OR2T2Q6IF00 324 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ARL9Q6T311 187 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 USP51Q70EK9 711 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SPATC1Q76KD6 591 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OR5AS1Q8N127 324 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ST7LQ8TDW4 575 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OTULINQ96BN8 352 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 HAVCR1Q96D42 359 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CHODLQ9H9P2 273 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 H3BNX3 289 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 M0R129 80 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 M0R135 149 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SELENOFO60613 162 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 GLCEO94923 617 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ADH4P08319 380 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SLC2A5P22732 501 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 FASP25445 335 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 GSTT1P30711 240 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CRYBB2P43320 205 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 MOGQ16653 247 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 AVPI1Q5T686 147 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CPOQ8IVL8 374 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 TIGD4Q8IY51 512 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF799Q96GE5 643 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 MARCH7Q9H992 704 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SAP30LQ9HAJ7 183 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 GPR160Q9UJ42 338 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 JMJD1CQ15652 2540 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PLSCR5A0PG75 271 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC182A6NF36 153 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 G3V2T6 193 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 H0YL77 283 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PRKYO43930 277 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CRLF1O75462 422 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CIB2O75838 187 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 LCATP04180 440 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 HMGN1P05114 100 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CD55P08174 381 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 SLC2A1P11166 492 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 RAC2P15153 192 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 TUBG1P23258 451 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 RGS6P49758 472 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PRKXP51817 358 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM33P57088 247 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ACTR3P61158 418 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ECH1Q13011 328 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 KLHL12Q53G59 568 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 FAM209AQ5JX71 171 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 PARP8Q8N3A8 854 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-210ENST00000428861 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms