RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RGS6	P49758	472 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	COX10	Q12887	443 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF154	Q13106	437 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	COG8	Q96MW5	612 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	COQ7	Q99807	217 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CD300A	Q9UGN4	299 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449		F5H5K5	113 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SURF4	O15260	269 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	REN	P00797	406 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PSKH1	P11801	424 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HSD17B1	P14061	328 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF12	P17014	697 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	FPR3	P25089	353 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PMEL	P40967	661 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GYS2	P54840	703 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PITX2	Q99697	317 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ARPC3	O15145	178 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	FABP3	P05413	133 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ACSM4	P0C7M7	580 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	NOS3	P29474	1203 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PYCR1	P32322	319 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GGT2	P36268	569 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	GSS	P48637	474 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPRK-208	ENST00000392449	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449		A8MXK9	166 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449		J3QW42	95 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	WNT2	P09544	360 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SMIM11A	P58511	58 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MAP6	Q96JE9	813 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	ATF6B	Q99941	703 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TVP23A	A6NH52	213 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	FPR2	P25090	351 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	CD80	P33681	288 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPRK-208	ENST00000392449	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19

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