RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621181.4

CLK1-215, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-215ENST00000621181 B4GALT1P15291 398 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ADRA2CP18825 462 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 GADD45AP24522 165 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CD40LGP29965 261 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CRATP43155 626 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 GIPRP48546 466 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SERPINB10P48595 397 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SELENOVP59797 346 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 LMO4P61968 165 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CCL8P80075 99 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CDK6Q00534 326 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CD300CQ08708 224 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 TRIM16LQ309B1 348 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 LRP11Q86VZ4 500 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 NANPQ8TBE9 248 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 MYDGFQ969H8 173 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RAB39BQ96DA2 213 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 MMP27Q9H306 513 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 TMEM247A6NEH6 219 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 J3KTA2 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 AIREO43918 545 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CDC14BO60729 498 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PTHP01270 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ADORA3P0DMS8 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ETV6P41212 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RAD52P43351 418 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 OR1E2P47887 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CDH12P55289 794 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 HOXC5Q00444 222 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 DEFA6Q01524 100 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 EGR4Q05215 589 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 FOXL1Q12952 345 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 TIGD6Q17RP2 521 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 AVPI1Q5T686 147 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ADCK1Q86TW2 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 UEVLDQ8IX04 471 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 TMEM123Q8N131 208 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLK1-215ENST00000621181 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 EMC6Q9BV81 110 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ESM1Q9NQ30 184 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 GPR160Q9UJ42 338 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLK1-215ENST00000621181 PLPP2O43688 288 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RP2O75695 350 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 UPK1BO75841 260 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RHCEP18577 417 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 GRPRP30550 384 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 MAGEB1P43366 347 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RGS6P49758 472 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLK1-215ENST00000621181 RAB1AP62820 205 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SPIBQ01892 262 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 PRKCDQ05655 676 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 DUSP7Q16829 419 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 ZNF404Q494X3 552 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-215ENST00000621181 OR52J3Q8NH60 311 aa6.68□□□□□ -1.34
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