RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R14AQ96A00 147 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SVILO95425 2214 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 HPP00738 406 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 PITPNBP48739 271 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 DNASE1L1P49184 302 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 DIO1P49895 249 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 AVPI1Q5T686 147 aa16■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 WDR54Q9H977 334 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 IL17BQ9UHF5 180 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.99■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 RNF32Q9H0A6 362 aa15.99■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 GSG1LQ6UXU4 331 aa15.99■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 CHAF1BQ13112 559 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 MS4A18Q3C1V0 323 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 DOCK7Q96N67 2140 aa15.98■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 SLC36A2Q495M3 483 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDE4D-204ENST00000358923 CD3GP09693 182 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 HACD4Q5VWC8 232 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 KLHL13Q9P2N7 655 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 MT-ND4P03905 459 aa15.97■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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