RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 FAM74A1Q5RGS3 127 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 NR2C2APQ86WQ0 139 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 PADI1Q9ULC6 663 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 PCSK5Q92824 1860 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1B0GW55 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 STARP49675 285 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 TPBGQ13641 420 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 DUX4Q9UBX2 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM82A0PJX8 343 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 SULT1C2O00338 296 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 GABRPO00591 440 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 RAD1O60671 282 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 RAMP1O60894 148 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 SLC6A8P48029 635 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 PRPS1P60891 318 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 LINC01590Q5TEZ4 76 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 AMELYQ99218 206 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 PARD6AQ9NPB6 346 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 HPXP02790 462 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 CALCRP30988 508 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 S100A11P31949 105 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 FOLR3P41439 243 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 GRINAQ7Z429 371 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 C5orf34Q96MH7 638 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 TCFL5Q9UL49 500 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF814B7Z6K7 855 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 HLA-DQA2P01906 255 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 RNF224P0DH78 156 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 OR10A3P58181 314 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TGIF1Q15583 401 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 MICBQ29980 383 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 POC1BQ8TC44 478 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 DISC1C4P0D8 188 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 MCRIP1C9JLW8 97 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SDHAP31040 664 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 IL10RAQ13651 578 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TOMM20Q15388 145 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 BPIFCQ8NFQ6 507 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 SNX33Q8WV41 574 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 NPIPB7O75200 414 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 WNT11O96014 354 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 IGHV2-70P01814 119 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 DHODHQ02127 395 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 RNLSQ5VYX0 342 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM17Q86X19 198 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM156Q8N614 296 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 PELI1Q96FA3 418 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.01■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 A8MVM7 634 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 GATBO75879 557 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 GP1BAP07359 652 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 GABRA5P31644 462 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 IDNKQ5T6J7 187 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 HES3Q5TGS1 186 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16■□□□□ 0.15
PDE4D-204ENST00000358923 GHSRQ92847 366 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms