RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGDIA	P52565	204 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH12	P55289	794 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1CB	P62140	327 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	GNB2	P62879	340 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD1	Q15116	288 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF9	Q16594	264 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TTMP	Q5BVD1	217 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MTX3	Q5HYI7	312 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKBID	Q8NI38	313 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS33A	Q96AX1	596 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf173	Q96LM9	149 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0B4J2E0	115 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GX12	115 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MXK9	166 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRM5	B3KS81	715 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIC1	O00299	241 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SURF4	O15260	269 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ERLIN1	O75477	346 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	CH25H	O95992	272 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	CD55	P08174	381 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ADH4	P08319	380 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PGA4	P0DJD7	388 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PGA3	P0DJD8	388 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA3	P29320	983 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT5A	P41221	380 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PAX8	Q06710	450 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYND11	Q15326	602 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	RGN	Q15493	299 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SGCA	Q16586	387 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NRN1L	Q496H8	165 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRN	Q5BIV9	151 aa		9.07	□□□□□ -0.96
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SKAP2-209	ENST00000497511	GPR157	Q5UAW9	335 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
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SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL9	Q6T311	187 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MCHR2	Q969V1	340 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	UPRT	Q96BW1	309 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF347	Q96SE7	839 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGDIG	Q99819	225 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NANS	Q9NR45	359 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPO	Q9NVS9	261 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	C1RL	Q9NZP8	487 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		9.07	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRG6	482 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	BIRC5	O15392	142 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	MGRN1	O60291	552 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TPST1	O60507	370 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA7	O95182	113 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAT	P00750	562 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	IDO1	P14902	403 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF32	P17041	273 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTM3	P21266	225 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ETV4	P43268	484 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	FADD	Q13158	208 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	STX3	Q13277	289 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	HHAT	Q5VTY9	493 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	REEP3	Q6NUK4	255 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		9.06	□□□□□ -0.96
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD8	Q96LT4	415 aa		9.06	□□□□□ -0.96

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