RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 FAPQ12884 760 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SHBQ15464 509 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ZNF529Q6P280 563 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 COMTD1Q86VU5 262 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ZNF385DQ9H6B1 395 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 F5P12259 2224 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GABARAPH6UMI1 98 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 KITLGP21583 273 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GUSBP11Q6P575 273 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR51E1Q8TCB6 317 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ATF6BQ99941 703 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 PPP3CBP16298 524 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SDHBP21912 280 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 BTG1P62324 171 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 S100PBPQ96BU1 408 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR6C6A6NF89 314 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SLC2A10O95528 541 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 LGALS4P56470 323 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G7Q13093 441 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 MDGA2Q7Z553 956 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 CTSFQ9UBX1 484 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 R4GMQ9 66 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 DHHO43323 396 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GLAP06280 429 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 RNLSQ5VYX0 342 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR4D9Q8NGE8 314 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR2A5Q96R48 311 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 CRLF2Q9HC73 371 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TTC3P53804 2025 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TUSC2O75896 110 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 FOXF1Q12946 379 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR5T1Q8NG75 326 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SDSLQ96GA7 329 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TRAV17A0A0B4J275 112 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SLC22A20A6NK97 555 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR2A2Q6IF42 318 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR4D6Q8NGJ1 314 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR52N5Q8NH56 324 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 MALSU1Q96EH3 234 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WUJ7 227 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GUSBP08236 651 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ZNF573Q86YE8 665 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 LGI3Q8N145 548 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 GPR173Q9NS66 373 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 CHATP28329 748 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SMIM19Q96E16 107 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 RAD52P43351 418 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 RAB11AP62491 216 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 KRBOX4Q5JUW0 171 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OR1L3Q8NH93 324 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 MED29Q9NX70 200 aa15.47■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 K7EQS6 105 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 SLC17A1Q14916 467 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 MYF5P13349 255 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TNFSF11O14788 317 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 CTSVO60911 334 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0040Q15053 153 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.46■□□□□ 0.07
NISCH-213ENST00000489895 POC1BQ8TC44 478 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97 ms