RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FntbQ8K2I1 437 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1048Q8VGS2 320 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl24Q9CQ06 216 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem218Q9CQ44 115 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Emc4Q9CZX9 183 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lgals8Q9JL15 316 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Htr6Q9R1C8 440 aa20.47■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Crisp2P16563 243 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tspan5P62080 268 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Them4Q3UUI3 230 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tas2r143Q7TQB9 293 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q80UB0 333 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc29Q80VM3 471 aa20.47■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1512Q8VF72 313 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr862Q8VFJ1 306 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Erv3Q9DAX3 200 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp18Q9WTV6 368 aa20.47■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp4a31F8WGU9 509 aa20.46■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mettl7a3G3X9G9 244 aa20.46■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Opn1mwO35599 359 aa20.46■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rad51dO55230 329 aa20.46■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sult2a1P52843 285 aa20.46■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 S100a13P97352 98 aa20.46■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa20.46■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1351Q8VGU6 319 aa20.46■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spint2Q9WU03 252 aa20.46■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1255A2AUA4 310 aa20.45■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930451I11RikE9Q9R3 111 aa20.45■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hsd17b12O70503 312 aa20.45■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Alox5apP30355 161 aa20.45■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Capza1P47753 286 aa20.45■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ca10P61215 328 aa20.45■□□□□ 0.87
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GnrhrQ01776 327 aa20.45■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sntb1Q99L88 537 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cldn12Q9ET43 244 aa20.45■□□□□ 0.87
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr545Q9WU94 316 aa20.44■□□□□ 0.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmed3Q78IS1 221 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr776Q7TRI3 312 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Timmdc1Q8BUY5 285 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc38a1Q8K2P7 485 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubac2Q8R1K1 345 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn1r23Q8R2D0 302 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rab7bQ8VEA8 199 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pycr1Q922W5 309 aa20.44■□□□□ 0.86
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sdf2Q9DCT5 211 aa20.44■□□□□ 0.86
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igkv9-124A0A0G2JDR3 117 aa20.43■□□□□ 0.86
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