RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556020.1

GPHN-211, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-211ENST00000556020 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 ZNF570Q96NI8 536 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 DECR2Q9NUI1 292 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 STAB1Q9NY15 2570 aa14.67□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 FAM157AC9JC47 383 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SPRY3O43610 288 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 RP2O75695 350 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 IGHV3-13P01766 116 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SCG5P05408 212 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 CD14P08571 375 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 TMEM33P57088 247 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 MVKQ03426 396 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 MOGQ16653 247 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 MESTQ5EB52 335 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 OR52J3Q8NH60 311 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 RASD2Q96D21 266 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 POLE4Q9NR33 117 aa14.66□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 PLSCR5A0PG75 271 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 B4DSR2 109 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 NGFP01138 241 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 ZNF81P51508 661 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 PPP1CBP62140 327 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 USP51Q70EK9 711 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 AURKCQ9UQB9 309 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 CACNG2Q9Y698 323 aa14.65□□□□□ -0.06
GPHN-211ENST00000556020 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 PRSS37A4D1T9 235 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 SOCS2O14508 198 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 DOK2O60496 412 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 NDUFB2O95178 105 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 RHCEP18577 417 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 PRDX6P30041 224 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 TEKQ02763 1124 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 KRT72Q14CN4 511 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 SEC23BQ15437 767 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 C1orf159Q96HA4 380 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 C4orf45Q96LM5 186 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 SYT4Q9H2B2 425 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.64□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 A0A1W2PRQ8 180 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 UNC119BA6NIH7 251 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 IMPA2O14732 288 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 SNX3O60493 162 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 SLC16A7O60669 478 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 ABHD16AO95870 558 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 IGHV1-46P01743 117 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 TFP02787 698 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 GAAP10253 952 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 CTLA4P16410 223 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 CRYBB2P43320 205 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 HTR5AP47898 357 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 ARHGDIAP52565 204 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 DGCR6Q14129 220 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 HFEQ30201 348 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 FAM122BQ7Z309 247 aa14.63□□□□□ -0.07
GPHN-211ENST00000556020 TMEM186Q96B77 213 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms