RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	PUDP	Q08623	228 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAM1	Q15629	374 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	EXT1	Q16394	746 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR6V1	Q8N148	313 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	NCDN	Q9UBB6	729 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	GNG8	Q9UK08	70 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193		G3V3Q6	166 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	STK17B	O94768	372 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	REN	P00797	406 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MSX1	P28360	303 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2T4	Q8NH00	348 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SYT4	Q9H2B2	425 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A087WV48	116 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PLPP3	O14495	311 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR6A2	O95222	327 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CD59	P13987	128 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	DLX5	P56178	289 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXF1	Q12946	379 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ACKR1	Q16570	336 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR56B4	Q8NH76	319 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ARL5B	Q96KC2	179 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	COPZ2	Q9P299	210 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ACOD1	A6NK06	481 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	XKRY	O14609	159 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	IFNA7	P01567	189 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	FOLR3	P41439	243 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	BLVRA	P53004	296 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	GRK1	Q15835	563 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	HACD4	Q5VWC8	232 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	KLK11	Q9UBX7	282 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	AUP1	Q9Y679	476 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OGG1	O15527	345 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TSPAN5	P62079	268 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SIRPA	P78324	504 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CDK5R1	Q15078	307 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	AANAT	Q16613	207 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM65	Q6PI78	240 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	OR52I2	Q8NH67	350 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	M1AP	Q8TC57	530 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM19	Q96E16	107 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	STRADB	Q9C0K7	418 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.15
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GVI7	797 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	PEX14	O75381	377 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	IL11	P20809	199 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	EDNRA	P25101	427 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN6	P56747	220 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	STPG1	Q5TH74	334 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	OR6S1	Q8NH40	331 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF519	Q8TB69	540 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	NOX4	Q9NPH5	578 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	PADI1	Q9ULC6	663 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA2	Q9UM82	520 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R233	179 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF208	O43345	1280 aa		14.08	□□□□□ -0.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms