RNA–Protein interactions for RNA: YLR373C

VID22, Transcript of Glycosylated integral membrane protein localized to plasma membrane, yeast

Gene VID22, Length 2,706 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VID22	YLR373C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	HEM3	P28789	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YME1	P32795	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BIO4	P53630	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CSM3	Q04659	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RGA2	Q06407	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NYV1	Q12255	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TEC1	P18412	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RRT12	P25381	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RCK2	P38623	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ASI2	P53895	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PLP1	Q04004	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ARP9	Q05123	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ENV9	Q08651	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SLA2	P33338	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BLI1	P35727	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CCL1	P37366	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ERC1	P38767	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ICP55	P40051	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SHE10	P53075	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FAR11	P53917	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	ASA1	Q06822	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CHS2	P14180	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	KTR2	P33550	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SEG2	P34250	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RPC37	P36121	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DOT5	P40553	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	THI6	P41835	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	STB1	P42845	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MSN5	P52918	1224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PIP2	P52960	996 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RET3	P53600	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MGR3	Q04472	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	LAP2	Q10740	671 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RIM15	P43565	1770 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FOB1	O13329	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SNA3	P14359	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TFC4	P33339	1025 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	NUP120	P35729	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TGL4	P36165	910 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	MMT1	Q03218	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	DPH6	Q12429	685 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	GCR1	P07261	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	HEM15	P16622	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	RAD14	P28519	371 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SWC5	P38326	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SMF2	P38778	549 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	JEM1	P40358	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FMP33	P46998	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CLA4	P48562	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YNL058C	P53947	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	COA4	Q05809	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	FAR10	Q06001	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	APM4	Q99186	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	KIP1	P28742	1111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VID22	YLR373C	BRL1	P38770	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.8 ms