RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PZF1	P39933	429 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	STU2	P46675	888 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	ZIP2	P53061	704 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	PKH1	Q03407	766 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	COG8	Q04632	607 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	HOG1	P32485	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	NGG1	P32494	702 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	TIM44	Q01852	431 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	TFB2	Q02939	513 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	IRC13	Q08630	104 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
YLR224W	YLR224W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	RAD18	P10862	487 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	SFP1	P32432	683 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	SDS3	P40505	327 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YFL052W	P43551	465 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	DOS2	P54858	310 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	NHX1	Q04121	633 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	TGL5	Q12043	749 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	MET3	P08536	511 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	PCL2	P25693	308 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YKR051W	P36142	418 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	SIC1	P38634	284 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YJL163C	P46996	555 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	BNA2	P47125	453 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	NPY1	P53164	384 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YLR415C	O13578	112 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	HSL7	P38274	827 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	HOS4	P40480	1083 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	AIM14	P53109	570 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YNL193W	P53870	558 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	NRG1	Q03125	231 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	PEX2	P32800	271 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	BRN1	P38170	754 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.84	□□□□□ -1.79
YLR224W	YLR224W	HMG1	P12683	1054 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	SFL1	P20134	766 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YHL017W	P38745	532 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	PCL5	P38794	229 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YJR142W	P47173	342 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YBP2	P53169	641 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ATG33	Q06485	197 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ADR1	P07248	1323 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	BNR1	P40450	1375 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YKR018C	P36114	725 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YBR259W	P38338	688 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ECM1	P39715	212 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	MGS1	P40151	587 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ATF1	P40353	525 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ORC4	P54791	529 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	DNM1	P54861	757 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ARP4	P80428	489 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	GUD1	Q07729	489 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	UBS1	P38290	277 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	TDP1	P38319	544 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YIR042C	P40586	236 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	HLJ1	P48353	224 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	PCL10	P53124	433 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	GIN4	Q12263	1142 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	FLO10	P36170	1169 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	APT2	P36973	181 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	BCD1	P38772	366 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	TAH11	P47112	604 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	AMA1	P50082	593 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	MET13	P53128	600 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	MTL1	P53214	551 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	NUP145	P49687	1317 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	HIR1	P32479	840 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YHR112C	P38716	378 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	LYS9	P38999	446 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	YNL195C	P40168	261 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	PMT3	P47190	753 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	GAD1	Q04792	585 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	MCM21	Q06675	368 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YLR224W	YLR224W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms