RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 POTECB2RU33 542 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 MSX1P28360 303 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TYRO3Q06418 890 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEAL1Q15170 157 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 GPRASP2Q96D09 838 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 ELP3Q9H9T3 547 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K1Q13233 1512 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TIAM1Q13009 1591 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 EGFRP00533 1210 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SPACA7Q96KW9 195 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 BCO2Q9BYV7 579 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NPHS2Q9NP85 383 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTN3Q9P232 1028 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 MRC2Q9UBG0 1479 aa5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PNR3 127 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 PHACTR2O75167 634 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 VEGFBP49765 207 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 GAPVD1Q14C86 1478 aa5.88□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GTH6 734 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 EREGO14944 169 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 THBS1P07996 1170 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 RHOQP17081 205 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NFE2L2Q16236 605 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 GPATCH3Q96I76 525 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SPON2Q9BUD6 331 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR62O43379 1518 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD9Q5K651 1589 aa5.87□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS12P58397 1594 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K10Q02779 954 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SERINC3Q13530 473 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 GRM2Q14416 872 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF4Q96M43 638 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 HCN2Q9UL51 889 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.478e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-210ENST00000590211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 XYLBO75191 536 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 AVPP01185 164 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP2P12643 396 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNQ4P56696 695 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 ERCC6Q03468 1493 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPNS1-210ENST00000590211 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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