RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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CAPNS1-202ENST00000586851 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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CAPNS1-202ENST00000586851 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.01□□□□□ -0.97
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CAPNS1-202ENST00000586851 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 FERMT3Q86UX7 667 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-202ENST00000586851 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
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