RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SPEF2	Q9C093	1822 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CSF1R	P07333	972 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	JMY	Q8N9B5	988 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	XDH	P47989	1333 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	UFL1	O94874	794 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	ECE2	O60344	883 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD14	O00487	310 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGA6	P23229	1130 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXO4	P98177	505 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	DPF2	Q92785	391 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	GRM8	O00222	908 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH1L1	O75891	902 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PSME4	Q14997	1843 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRC	P08575	1304 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF609	O15014	1411 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C1D1	291 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200	UTY	O14607	1347 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-205	ENST00000563200		G3V3G9	751 aa		27.58	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.58	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		27.58	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.58	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAF5	O00463	557 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	EGFR	P00533	1210 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRND	Q07001	517 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	CST9	Q5W186	159 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	GML	Q99445	158 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRK1	P26718	216 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-205	ENST00000563200	MIER1	Q8N108	512 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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