RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 UFL1O94874 794 aa23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR90Q96KV7 1748 aa23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 GGA1Q9UJY5 639 aa23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.46■■□□□ 1.35
GCSHP2-201ENST00000560971 XDHP47989 1333 aa23.45■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 TOMM70O94826 608 aa23.45■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 TNNQ9UQP3 1299 aa23.45■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.45■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 SPEF2Q9C093 1822 aa23.45■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 GPC2Q8N158 579 aa23.44■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.44■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.43■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 EYA3Q99504 573 aa23.43■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 YDJCA8MPS7 323 aa23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM27P14373 513 aa23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 CXCL9Q07325 125 aa23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 DOK7Q18PE1 504 aa23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.42■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 RAD17O75943 681 aa23.41■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP2B4P23634 1241 aa23.41■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.41■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRNDQ07001 517 aa23.39■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.39■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.39■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.39■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 ECE2O60344 883 aa23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 HACL1Q9UJ83 578 aa23.38■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 POTEIP0CG38 1075 aa23.37■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 POTEJP0CG39 1038 aa23.37■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.37■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.37■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TAF5LO75529 589 aa23.36■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 SCNN1DP51172 638 aa23.36■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 MEIS3Q99687 375 aa23.36■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.36■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.36■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 G3V3G9 751 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 SNAP23O00161 211 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 EPHX2P34913 555 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 EPS15P42566 896 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TNIP1Q15025 636 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.35■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMD14O00487 310 aa23.34■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 KLRK1P26718 216 aa23.34■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.34■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.34■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 MED23Q9ULK4 1368 aa23.34■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 SCN4AP35499 1836 aa23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 PLIN1O60240 522 aa23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNJ4P48050 445 aa23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 FSTL1Q12841 308 aa23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.33■■□□□ 1.33
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.32■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.32■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA6P17066 643 aa23.3■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC24Q50LG9 513 aa23.3■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.3■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 SHTN1A0MZ66 631 aa23.29■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 GNAI3P08754 354 aa23.29■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 RLBP1P12271 317 aa23.29■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 CHADLQ6NUI6 762 aa23.29■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.29■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 SCN9AQ15858 1988 aa23.29■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 PODNQ7Z5L7 613 aa23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 LDHDQ86WU2 507 aa23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.28■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1B0GUL6 1792 aa23.27■■□□□ 1.32
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP350Q5VT06 3117 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms