RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 BCAR3O75815 825 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC10A3P09131 477 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 PARP10Q53GL7 1025 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 IFT57Q9NWB7 429 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 GNAI1P63096 354 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF428Q96B54 188 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF853P0CG23 659 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 MYL6BP14649 208 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP2-204ENST00000548823 ADM5C9JUS6 153 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 PSMD14O00487 310 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 EGFRP00533 1210 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 AAMPQ13685 434 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 LAMB2P55268 1798 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 MS4A1P11836 297 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 GRAPQ13588 217 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 TMC4Q7Z404 712 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 SULF1Q8IWU6 871 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDSP2-204ENST00000548823 ERBB4Q15303 1308 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 WASHC4Q2M389 1173 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 CDCA5Q96FF9 252 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 GGA3Q9NZ52 723 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 TAF1P21675 1872 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 FKBP1BP68106 108 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D8O95759 1140 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 MBIPQ9NS73 344 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 CHL1O00533 1208 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF16BQ96L93 1317 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 RTL9Q8NET4 1388 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 RIMBP2O15034 1052 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 ECE2O60344 883 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 VAMP4O75379 141 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 NLRP10Q86W26 655 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR25O00155 361 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 C6orf229H3BNL8 230 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 POLLQ9UGP5 575 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 PDIA6Q15084 440 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 EYA3Q99504 573 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 TM4SF4P48230 202 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 DOK7Q18PE1 504 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP2-204ENST00000548823 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 PANK1Q8TE04 598 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 SCARF1Q14162 830 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 SCN9AQ15858 1988 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 GPSM2P81274 684 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP2-204ENST00000548823 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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