RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 CIAO1O76071 339 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.27■■□□□ 1.16
SYTL1-208ENST00000543823 CAMTA2O94983 1202 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 SUSD4Q5VX71 490 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 TCHHQ07283 1943 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 ITGA6P23229 1130 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 CTSWP56202 376 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.26■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 MYH3P11055 1940 aa22.26■■□□□ 1.15
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SYTL1-208ENST00000543823 ST3GAL1Q11201 340 aa22.25■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 GPR108Q9NPR9 543 aa22.25■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.25■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 USP21Q9UK80 565 aa22.25■■□□□ 1.15
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SYTL1-208ENST00000543823 VPS53Q5VIR6 699 aa22.25■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.25■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.24■■□□□ 1.15
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SYTL1-208ENST00000543823 NECAB1Q8N987 351 aa22.24■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.24■■□□□ 1.15
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SYTL1-208ENST00000543823 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 ME3Q16798 604 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 GPT2Q8TD30 523 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.22■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 SCARF1Q14162 830 aa22.22■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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SYTL1-208ENST00000543823 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 A0A0G2JLW4 131 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 PI16Q6UXB8 463 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 XAGE2Q96GT9 111 aa22.21■■□□□ 1.15
SYTL1-208ENST00000543823 HSPA1LP34931 641 aa22.2■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 COL4A1P02462 1669 aa22.2■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.2■■□□□ 1.14
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SYTL1-208ENST00000543823 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.19■■□□□ 1.14
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SYTL1-208ENST00000543823 RNF20Q5VTR2 975 aa22.19■■□□□ 1.14
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SYTL1-208ENST00000543823 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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SYTL1-208ENST00000543823 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 CYP21A2P08686 494 aa22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 SYT1P21579 422 aa22.18■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 GJB2P29033 226 aa22.18■■□□□ 1.14
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SYTL1-208ENST00000543823 STK3Q13188 491 aa22.15■■□□□ 1.14
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SYTL1-208ENST00000543823 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 LRP5O75197 1615 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL1-208ENST00000543823 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.15■■□□□ 1.14
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