RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.41■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 PDE8AO60658 829 aa28.4■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 MAP2K2P36507 400 aa28.4■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.4■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 G3V3G9 751 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.39■■■□□ 2.14
CDKN2A-210ENST00000530628 AOC2O75106 756 aa28.38■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 USP48Q86UV5 1035 aa28.38■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.38■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 UFL1O94874 794 aa28.36■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 GGA1Q9UJY5 639 aa28.36■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 SCN9AQ15858 1988 aa28.36■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 RTL9Q8NET4 1388 aa28.36■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 TSPYL6Q8N831 410 aa28.35■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.35■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 MYH3P11055 1940 aa28.33■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 KSR2Q6VAB6 950 aa28.33■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.33■■■□□ 2.13
CDKN2A-210ENST00000530628 EGFRP00533 1210 aa28.32■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.32■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 STK31Q9BXU1 1019 aa28.32■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PSME4Q14997 1843 aa28.31■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.3■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.3■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.3■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.3■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 XDHP47989 1333 aa28.29■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CA12O43570 354 aa28.29■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 HUNKP57058 714 aa28.29■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 DLK2Q6UY11 383 aa28.29■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 TSKSQ9UJT2 592 aa28.29■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SPEF2Q9C093 1822 aa28.29■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC27Q2M243 656 aa28.28■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ABHD8Q96I13 439 aa28.28■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 IGKV5-2P06315 115 aa28.27■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ATP2B4P23634 1241 aa28.27■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CTSWP56202 376 aa28.27■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC184Q52MB2 194 aa28.27■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.27■■■□□ 2.12
CDKN2A-210ENST00000530628 NOGQ13253 232 aa28.26■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.26■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 ADM5C9JUS6 153 aa28.25■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 WWC1Q8IX03 1113 aa28.25■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.25■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 SULF1Q8IWU6 871 aa28.24■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 GGA3Q9NZ52 723 aa28.24■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.24■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 CACNA1FO60840 1977 aa28.23■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 SLC4A2P04920 1241 aa28.23■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 RGMBQ6NW40 437 aa28.23■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 PODNQ7Z5L7 613 aa28.23■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.22■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF609O15014 1411 aa28.22■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 G2E3Q7L622 706 aa28.22■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 GREM2Q9H772 168 aa28.21■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.21■■■□□ 2.11
CDKN2A-210ENST00000530628 USP17L3A6NCW0 530 aa28.2■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 USP17L4A6NCW7 530 aa28.2■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 SCARF1Q14162 830 aa28.2■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.2■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC102AQ96A19 550 aa28.2■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 ZIC5Q96T25 663 aa28.2■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 IL16Q14005 1332 aa28.19■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 H7C1W4 665 aa28.19■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 USP17L8P0C7I0 530 aa28.19■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.19■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 GMLQ99445 158 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 MED23Q9ULK4 1368 aa28.18■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 CDCA5Q96FF9 252 aa28.17■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.17■■■□□ 2.1
CDKN2A-210ENST00000530628 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.16■■■□□ 2.1
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