RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515536.1

RPS27AP18-201, Transcript of ribosomal protein S27a pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RPS27AP18, Length 459 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP18-201ENST00000515536 PSMD2Q13200 908 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 SERINC3Q13530 473 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 TMC4Q7Z404 712 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.32□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PRMT3O60678 531 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 AVPP01185 164 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 MUC3BQ9H195 1237 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 C12orf49Q9H741 205 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 FANCLQ9NW38 375 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ZNF69Q9UC07 566 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.31□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PIK3CDO00329 1044 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 MYL3P08590 195 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CBLBQ13191 982 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PTK7Q13308 1070 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RPAINQ86UA6 219 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 APPBP2Q92624 585 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ITPKCQ96DU7 683 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 PPCSQ9HAB8 311 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CHST12Q9NRB3 414 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 A6NJY4 79 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 USP17L5A8MUK1 530 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 TIMP2P16035 220 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ATF3P18847 181 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RASA1P20936 1047 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ATICP31939 592 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 USP4Q13107 963 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 Q6ZNB5 142 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 KRT77Q7Z794 578 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 USP48Q86UV5 1035 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CYLDQ9NQC7 956 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 POLG2Q9UHN1 485 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 AXIN1O15169 862 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 SLC26A4O43511 780 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 HMMRO75330 724 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 EPHB1P54762 984 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ERVK-9P63128 1117 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 DAB2P98082 770 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ARHGAP4P98171 946 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 EML3Q32P44 896 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ALDH1L2Q3SY69 923 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ZNF394Q53GI3 561 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ALFQ53S48 1182 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS27AP18-201ENST00000515536 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms