RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 SPEF2Q9C093 1822 aa24.71■■□□□ 1.55
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USP40-217ENST00000496298 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
USP40-217ENST00000496298 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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USP40-217ENST00000496298 GGA1Q9UJY5 639 aa24.71■■□□□ 1.55
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USP40-217ENST00000496298 E9PSI1 815 aa24.7■■□□□ 1.54
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USP40-217ENST00000496298 ECE2O60344 883 aa24.68■■□□□ 1.54
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USP40-217ENST00000496298 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
USP40-217ENST00000496298 PCNTO95613 3336 aa24.63■■□□□ 1.53
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USP40-217ENST00000496298 CNTNAP1P78357 1384 aa24.62■■□□□ 1.53
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USP40-217ENST00000496298 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.57■■□□□ 1.52
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USP40-217ENST00000496298 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.56■■□□□ 1.52
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USP40-217ENST00000496298 VEGFBP49765 207 aa24.54■■□□□ 1.52
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USP40-217ENST00000496298 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.54■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.54■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 KAZALD1Q96I82 304 aa24.54■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 COA1Q9GZY4 146 aa24.54■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
USP40-217ENST00000496298 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.51■■□□□ 1.51
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