RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	C6orf229	H3BNL8	230 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	FZD9	O00144	591 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	XDH	P47989	1333 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TTC3-223	ENST00000492275	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	GGA1	Q9UJY5	639 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	GNAI3	P08754	354 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	WASHC4	Q2M389	1173 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	UFL1	O94874	794 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	ATP2B4	P23634	1241 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275		A0A1B0GUL6	1792 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	RIMBP2	O15034	1052 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	PLIN1	O60240	522 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	CHRND	Q07001	517 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	EYA3	Q99504	573 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TTC3-223	ENST00000492275	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	KIF3C	O14782	793 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	POTEC	B2RU33	542 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	TAF5L	O75529	589 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	MS4A1	P11836	297 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	DOK7	Q18PE1	504 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	SNAP23	O00161	211 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	GNAI2	P04899	355 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC24	Q50LG9	513 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		32.26	■■■□□ 2.76
TTC3-223	ENST00000492275	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	CXCL9	Q07325	125 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	GPC2	Q8N158	579 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	MED23	Q9ULK4	1368 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	ECE2	O60344	883 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	MTX1	Q13505	466 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	KLRK1	P26718	216 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	RAD17	O75943	681 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	SCN4A	P35499	1836 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	KCNJ4	P48050	445 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	EYA2	O00167	538 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TTC3-223	ENST00000492275		G3V3G9	751 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	METTL24	Q5JXM2	366 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	PSME4	Q14997	1843 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	TNIP1	Q15025	636 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	SIL1	Q9H173	461 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TTC3-223	ENST00000492275	FBXO3	Q9UK99	471 aa		32.16	■■■□□ 2.74

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