RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM187AA6NFU0 413 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 FYB1O15117 783 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SPINT1O43278 529 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 DGAT1O75907 488 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP2B4P23634 1241 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SMTNP53814 917 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 CNKSR1Q969H4 720 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 A6NJY4 79 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 C21orf2O43822 256 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 IGFBP4P22692 258 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 FBLN1P23142 703 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 POTEAQ6S8J7 498 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 NME9Q86XW9 330 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TNS4Q8IZW8 715 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 DCCP43146 1447 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 GFRA3O60609 400 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 PRMT3O60678 531 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 RELBQ01201 579 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 USP6P35125 1406 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 CDK2AP1O14519 115 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXO3O43524 673 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 GPC1P35052 558 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 CENPCQ03188 943 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 BRINP3Q76B58 766 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 HINFPQ9BQA5 517 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 USP3Q9Y6I4 520 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 LGR5O75473 907 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 LAPTM4AQ15012 233 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TLR1Q15399 786 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 MSH6P52701 1360 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 ATF3P18847 181 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP2R1AP30153 589 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 COL26A1Q96A83 441 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-212ENST00000491266 MEN1O00255 615 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 ANP32CO43423 234 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PKDCCQ504Y2 493 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 RALBP1Q15311 655 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 NBPF15Q8N660 670 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 NLRP3Q96P20 1036 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 USP31Q70CQ4 1352 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 PXDNQ92626 1479 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-212ENST00000491266 CCER2I3L3R5 266 aa8.31□□□□□ -1.08
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