RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 KIF2CQ99661 725 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 DONSONQ9NYP3 566 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ELP1O95163 1332 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 PPP2R1AP30153 589 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 TMF1P82094 1093 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 COL19A1Q14993 1142 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 MCTP1Q6DN14 999 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ERO1AQ96HE7 468 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 AK9Q5TCS8 1911 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GUL7 405 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 BCAR3O75815 825 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 CEP89Q96ST8 783 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ST18O60284 1047 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 IVLP07476 585 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 SLC10A3P09131 477 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 TPM1P09493 284 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 NUCB1Q02818 461 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 NCOA4Q13772 614 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 RNF135Q8IUD6 432 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 GPT2Q8TD30 523 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 GCC1Q96CN9 775 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 ASB16Q96NS5 453 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 DEF6Q9H4E7 631 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.46□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.46□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PKP4-211ENST00000481115 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 RPS6KA5O75582 802 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 CAVIN2O95810 425 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 SCNN1AP37088 669 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 FAM107BQ9H098 131 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ADGRB2O60241 1585 aa8.46□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 SYCE3A1L190 88 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ICMTO60725 284 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ADCY5O95622 1261 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 CPP00450 1065 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ABL1P00519 1130 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 MAPK1P28482 360 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 MAGEA9P43362 315 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 DPYDQ12882 1025 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 TESK2Q96S53 571 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 TMEM94Q12767 1356 aa8.45□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD62A6NC57 917 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 H3BRB1 525 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 MYO1CO00159 1063 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ATP2B1P20020 1258 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 USP8P40818 1118 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 DESI1Q6ICB0 168 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 PPM1EQ8WY54 764 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 ZNF592Q92610 1267 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 EXOC4Q96A65 974 aa8.44□□□□□ -1.06
PKP4-211ENST00000481115 IL17RAQ96F46 866 aa8.44□□□□□ -1.06
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