RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	SMC2	O95347	1197 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SKIL	P12757	684 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	GYS2	P54840	703 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	NRDC	O43847	1150 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	MYO1C	O00159	1063 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT32	Q14532	448 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	MYD88	Q99836	296 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM66	O15016	1216 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SASH1	O94885	1247 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	BIN1	O00499	593 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	KDR	P35968	1356 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	STX1A	Q16623	288 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CHGB	P05060	677 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ELP1	O95163	1332 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	STK38	Q15208	465 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SSUH2-208	ENST00000455157	ADCY9	O60503	1353 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	TPM4	P67936	248 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	TFCP2	Q12800	502 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SSUH2-208	ENST00000455157	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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