RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 F6X3S4 739 aa26.73■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 EPS15P42566 896 aa26.73■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 CREBZFQ9NS37 354 aa26.73■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 BEND3Q5T5X7 828 aa26.72■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.72■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 ECE2O60344 883 aa26.71■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 ATP2B4P23634 1241 aa26.71■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 SLFN5Q08AF3 891 aa26.71■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 CNTROBQ8N137 903 aa26.71■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 PASKQ96RG2 1323 aa26.7■■□□□ 1.87
LTB-211ENST00000446745 YDJCA8MPS7 323 aa26.7■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 CASP7P55210 303 aa26.7■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 SPEF2Q9C093 1822 aa26.69■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 ALDH1L1O75891 902 aa26.69■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.69■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.69■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 H7C1D1 291 aa26.68■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 ITGA6P23229 1130 aa26.68■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 DOK7Q18PE1 504 aa26.68■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.68■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 CSF1RP07333 972 aa26.67■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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LTB-211ENST00000446745 PTPRCP08575 1304 aa26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 GRM8O00222 908 aa26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 PSMD14O00487 310 aa26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 DPF2Q92785 391 aa26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.66■■□□□ 1.86
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LTB-211ENST00000446745 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.65■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
LTB-211ENST00000446745 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.63■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 MED23Q9ULK4 1368 aa26.62■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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LTB-211ENST00000446745 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.62■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 MICALL2Q8IY33 904 aa26.62■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 PODNQ7Z5L7 613 aa26.61■■□□□ 1.85
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LTB-211ENST00000446745 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.61■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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LTB-211ENST00000446745 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.6■■□□□ 1.85
LTB-211ENST00000446745 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.6■■□□□ 1.85
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LTB-211ENST00000446745 PSME4Q14997 1843 aa26.57■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.57■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 CNTNAP1P78357 1384 aa26.57■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.56■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.56■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 COA1Q9GZY4 146 aa26.56■■□□□ 1.84
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LTB-211ENST00000446745 ZNF609O15014 1411 aa26.56■■□□□ 1.84
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LTB-211ENST00000446745 USP17L4A6NCW7 530 aa26.55■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 CHRNDQ07001 517 aa26.55■■□□□ 1.84
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LTB-211ENST00000446745 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.55■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.55■■□□□ 1.84
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LTB-211ENST00000446745 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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LTB-211ENST00000446745 UTYO14607 1347 aa26.53■■□□□ 1.84
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LTB-211ENST00000446745 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.52■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.52■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.52■■□□□ 1.84
LTB-211ENST00000446745 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 TRAF5O00463 557 aa26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 SUCLG2Q96I99 432 aa26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 PCNTO95613 3336 aa26.51■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 RASSF10A6NK89 507 aa26.5■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
LTB-211ENST00000446745 FBXW7Q969H0 707 aa26.5■■□□□ 1.83
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