RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.47■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 MAP2K2P36507 400 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 SCN9AQ15858 1988 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.46■■□□□ 1.03
VARS-216ENST00000428445 ADM5C9JUS6 153 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 DPF2Q92785 391 aa21.45■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 GOLGA2Q08379 1002 aa21.44■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 HUNKP57058 714 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 TSPYL6Q8N831 410 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 EYA3Q99504 573 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 IFT57Q9NWB7 429 aa21.43■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.42■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 UFL1O94874 794 aa21.42■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.42■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.42■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 GNAI1P63096 354 aa21.41■■□□□ 1.02
VARS-216ENST00000428445 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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VARS-216ENST00000428445 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.39■■□□□ 1.01
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VARS-216ENST00000428445 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 GGA1Q9UJY5 639 aa21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 FAM161AQ3B820 660 aa21.38■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.38■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CCDC184Q52MB2 194 aa21.38■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.38■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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VARS-216ENST00000428445 RGMBQ6NW40 437 aa21.36■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.36■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 IGKV5-2P06315 115 aa21.35■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 NOGQ13253 232 aa21.35■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 SCARF1Q14162 830 aa21.35■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.35■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.35■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.35■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.34■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
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VARS-216ENST00000428445 SPEF2Q9C093 1822 aa21.34■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CA12O43570 354 aa21.33■■□□□ 1.01
VARS-216ENST00000428445 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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VARS-216ENST00000428445 KSR2Q6VAB6 950 aa21.32■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 SULF1Q8IWU6 871 aa21.32■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.32■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 GREM2Q9H772 168 aa21.32■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 XDHP47989 1333 aa21.31■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 ATP2B4P23634 1241 aa21.31■■□□□ 1
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VARS-216ENST00000428445 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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VARS-216ENST00000428445 GMLQ99445 158 aa21.31■■□□□ 1
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VARS-216ENST00000428445 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.3■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 TRPA1O75762 1119 aa21.29■■□□□ 1
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VARS-216ENST00000428445 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.29■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 USP17L3A6NCW0 530 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 USP17L4A6NCW7 530 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 USP17L8P0C7I0 530 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 FBXW7Q969H0 707 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 CCDC102AQ96A19 550 aa21.28■■□□□ 1
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VARS-216ENST00000428445 RNF186Q9NXI6 227 aa21.28■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 MYH3P11055 1940 aa21.27■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.27■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 SLC10A3P09131 477 aa21.27■■□□□ 1
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VARS-216ENST00000428445 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
VARS-216ENST00000428445 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.26■□□□□ 0.99
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