RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418576.3

SEMA3B-202, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SEMA3B, Length 1,765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-202ENST00000418576 OLFM4Q6UX06 510 aa22.98■■□□□ 1.27
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SEMA3B-202ENST00000418576 COL4A1P02462 1669 aa22.98■■□□□ 1.27
SEMA3B-202ENST00000418576 MPNDQ8N594 471 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-202ENST00000418576 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.97■■□□□ 1.27
SEMA3B-202ENST00000418576 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.97■■□□□ 1.27
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SEMA3B-202ENST00000418576 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.94■■□□□ 1.26
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SEMA3B-202ENST00000418576 METTL24Q5JXM2 366 aa22.93■■□□□ 1.26
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SEMA3B-202ENST00000418576 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.92■■□□□ 1.26
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SEMA3B-202ENST00000418576 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 KCNJ4P48050 445 aa22.91■■□□□ 1.26
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SEMA3B-202ENST00000418576 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.91■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 UTRNP46939 3433 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 C6orf229H3BNL8 230 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 NFKBIEO00221 500 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 TAF5LO75529 589 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 SNED1Q8TER0 1413 aa22.9■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 UFL1O94874 794 aa22.89■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 PDE8BO95263 885 aa22.89■■□□□ 1.26
SEMA3B-202ENST00000418576 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.89■■□□□ 1.26
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SEMA3B-202ENST00000418576 POLLQ9UGP5 575 aa22.89■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 VPS33BQ9H267 617 aa22.88■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.88■■□□□ 1.25
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SEMA3B-202ENST00000418576 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-202ENST00000418576 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 RAB11FIP3O75154 756 aa22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-202ENST00000418576 UBE4AQ14139 1066 aa22.86■■□□□ 1.25
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SEMA3B-202ENST00000418576 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.86■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 DCTPP1Q9H773 170 aa22.85■■□□□ 1.25
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SEMA3B-202ENST00000418576 PPIP5K2O43314 1243 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 SASH1O94885 1247 aa22.84■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 LTBP1Q14766 1721 aa22.83■■□□□ 1.25
SEMA3B-202ENST00000418576 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.83■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.83■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 LPIN2Q92539 896 aa22.83■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 SNAP23O00161 211 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 ATP2B3Q16720 1220 aa22.82■■□□□ 1.24
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SEMA3B-202ENST00000418576 JDP2Q8WYK2 163 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 MED23Q9ULK4 1368 aa22.82■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 G3V3G9 751 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 APBB1O00213 710 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 RIMBP2O15034 1052 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 SLC5A1P13866 664 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 GCC1Q96CN9 775 aa22.81■■□□□ 1.24
SEMA3B-202ENST00000418576 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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