RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417855.1

TTLL4-205, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, human

TSL 3

Gene TTLL4, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL4-205	ENST00000417855	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	BCO2	Q9BYV7	579 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	USP17L7	P0C7H9	530 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	MX2	P20592	715 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	LMNB1	P20700	586 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NRL	P54845	237 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PWP1	Q13610	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	VPS37D	Q86XT2	251 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	KLRG1	Q96E93	195 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SETDB2	Q96T68	719 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CNTN3	Q9P232	1028 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	DACH1	Q9UI36	760 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PPFIA3	O75145	1194 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	MAP2K3	P46734	347 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	FCGRT	P55899	365 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SIK1	P57059	783 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SYT9	Q86SS6	491 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	RELL1	Q8IUW5	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	C8orf37	Q96NL8	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	OSMR	Q99650	979 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CEP44	Q9C0F1	390 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CHRD	Q9H2X0	955 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	STRN4	Q9NRL3	753 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	GGT7	Q9UJ14	662 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SAMM50	Q9Y512	469 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	USP31	Q70CQ4	1352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855		A0A1W2PP55	124 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	GPR25	O00155	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SIN3B	O75182	1162 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	KIF4A	O95239	1232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ADH6	P28332	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	IRS1	P35568	1242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CABP4	P57796	275 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	GPLD1	P80108	840 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	FANCC	Q00597	558 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	GRM2	Q14416	872 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PI16	Q6UXB8	463 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	USP48	Q86UV5	1035 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	FAM35A	Q86V20	835 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	DRC1	Q96MC2	740 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	SLC30A3	Q99726	388 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ZFAT	Q9P243	1243 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ABCC9	O60706	1549 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	ARAF	P10398	606 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	VEGFB	P49765	207 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	CTBS	Q01459	385 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
TTLL4-205	ENST00000417855	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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