RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 BCAR3O75815 825 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 KAZALD1Q96I82 304 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 COL4A5P29400 1685 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 UFL1O94874 794 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 XDHP47989 1333 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP2B4P23634 1241 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL9Q07325 125 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF16BQ96L93 1317 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 DOK7Q18PE1 504 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 HACL1Q9UJ83 578 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP4-204ENST00000416021 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 YDJCA8MPS7 323 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD17O75943 681 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 FSTL1Q12841 308 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 TNIP1Q15025 636 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR90Q96KV7 1748 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 G3V3G9 751 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHX2P34913 555 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRNDQ07001 517 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 ECE2O60344 883 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA6P17066 643 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 SCNN1DP51172 638 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEIP0CG38 1075 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEJP0CG39 1038 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM27P14373 513 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 EPS15P42566 896 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 TNNQ9UQP3 1299 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMD14O00487 310 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF5LO75529 589 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH3P11055 1940 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNJ4P48050 445 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 CHADLQ6NUI6 762 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 PLIN1O60240 522 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 PODNQ7Z5L7 613 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 LDHDQ86WU2 507 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 LTBP1Q14766 1721 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAP23O00161 211 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIS3Q99687 375 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 MED23Q9ULK4 1368 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP4-204ENST00000416021 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 DPF2Q92785 391 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 COA1Q9GZY4 146 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRK1P26718 216 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C1D1 291 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAI3P08754 354 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 APLP1P51693 650 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC24Q50LG9 513 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L3A6NCW0 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L4A6NCW7 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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