RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 PDE8BO95263 885 aa24.76■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.76■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.76■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.76■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 CHMLP26374 656 aa24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 DDR1Q08345 913 aa24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 SERPINB2P05120 415 aa24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1B0GUL6 1792 aa24.74■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 NPHP1O15259 732 aa24.74■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 EVI5LQ96CN4 794 aa24.74■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.73■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ATP2B3Q16720 1220 aa24.73■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.73■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 XAGE2Q96GT9 111 aa24.73■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 BAG6P46379 1132 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ADORA1P30542 326 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 SLC15A2Q16348 729 aa24.72■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 FGFR2P21802 821 aa24.71■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 HAUS7Q99871 368 aa24.71■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 MSH5O43196 834 aa24.7■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.7■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
HDDC3-202ENST00000394272 ST5P78524 1137 aa24.7■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.7■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 CHRNDQ07001 517 aa24.68■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 LPIN2Q92539 896 aa24.68■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 STK32BQ9NY57 414 aa24.68■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.68■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 CRY2Q49AN0 593 aa24.67■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 TAF5LO75529 589 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 REC8O95072 547 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 GORABQ5T7V8 394 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 USP26Q9BXU7 913 aa24.66■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 IL25Q9H293 177 aa24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.65■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.64■■□□□ 1.54
HDDC3-202ENST00000394272 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 SLC5A1P13866 664 aa24.64■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 FSD1Q9BTV5 496 aa24.64■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 SNAP23O00161 211 aa24.63■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 HIP1O00291 1037 aa24.63■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 SGSM2O43147 1006 aa24.63■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.63■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 MMP10P09238 476 aa24.62■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 GRAPQ13588 217 aa24.62■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC125Q86Z20 511 aa24.62■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.62■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 SCARF1Q14162 830 aa24.61■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC102BQ68D86 513 aa24.61■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.61■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 GOLIM4O00461 696 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 PHKA1P46020 1223 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 UBE4AQ14139 1066 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 MSL1Q68DK7 614 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 TICAM2Q86XR7 235 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.6■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 MCAMP43121 646 aa24.59■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.59■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 KIF2CQ99661 725 aa24.58■■□□□ 1.53
HDDC3-202ENST00000394272 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.58■■□□□ 1.52
HDDC3-202ENST00000394272 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HDDC3-202ENST00000394272 FAM227BQ96M60 508 aa24.58■■□□□ 1.52
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.58■■□□□ 1.52
HDDC3-202ENST00000394272 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.58■■□□□ 1.52
HDDC3-202ENST00000394272 SNRKQ9NRH2 765 aa24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms