RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CFHP08603 1231 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 MCCP23508 829 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAR2BP31323 418 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TTC22Q5TAA0 569 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 RBSNQ9H1K0 784 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 TSPY26PQ9H489 355 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 IFT57Q9NWB7 429 aa8.66□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 KDRP35968 1356 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 USP26Q9BXU7 913 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CTPS1-201ENST00000372616 CPDO75976 1380 aa8.65□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 DMTNQ08495 405 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 DCTPP1Q9H773 170 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 POTEB2H3BUK9 544 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 HMOX1P09601 288 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ANAPC15P60006 121 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 NFE2L2Q16236 605 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ERC2O15083 957 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SOX11P35716 441 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA3Q99758 1704 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 HMMRO75330 724 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SKIP12755 728 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1AP38606 617 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 AK9Q5TCS8 1911 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 GPT2Q8TD30 523 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 KIF3AQ9Y496 699 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 COL18A1P39060 1754 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PHLPP1O60346 1717 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SYCE3A1L190 88 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L3A6NCW0 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L4A6NCW7 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 VAMP4O75379 141 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 NCAPD2Q15021 1401 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 RGPD5Q99666 1765 aa8.61□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ERBB3P21860 1342 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 NR1H3Q13133 447 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 CUL4AQ13619 759 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PNMA1Q8ND90 353 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 FEZ1Q99689 392 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRCP08575 1304 aa8.6□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINB4P48594 390 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 SYCP1Q15431 976 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 IL17RAQ96F46 866 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0232Q92628 1395 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L5A8MUK1 530 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 KCNH2Q12809 1159 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.59□□□□□ -1.03
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.59□□□□□ -1.03
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