RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS6KB1P23443 525 aa28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM13BQ9NYF5 915 aa28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 TIMM10P62072 90 aa28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.37■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.37■■■□□ 2.13
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AMIGO1-201ENST00000369862 PIGBQ92521 554 aa28.35■■■□□ 2.13
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR108Q9NPR9 543 aa28.35■■■□□ 2.13
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AMIGO1-201ENST00000369862 ATG3Q9NT62 314 aa28.32■■■□□ 2.12
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AMIGO1-201ENST00000369862 CYP21A2P08686 494 aa28.28■■■□□ 2.12
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
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AMIGO1-201ENST00000369862 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.28■■■□□ 2.12
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AMIGO1-201ENST00000369862 MYRIPQ8NFW9 859 aa28.27■■■□□ 2.12
AMIGO1-201ENST00000369862 NEK1Q96PY6 1258 aa28.27■■■□□ 2.12
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AMIGO1-201ENST00000369862 SPTLC3Q9NUV7 552 aa28.26■■■□□ 2.11
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AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.25■■■□□ 2.11
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AMIGO1-201ENST00000369862 BCL9O00512 1426 aa28.21■■■□□ 2.11
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AMIGO1-201ENST00000369862 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 MAST3O60307 1309 aa28.19■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 AP5Z1O43299 807 aa28.19■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.19■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCB2Q00722 1185 aa28.19■■■□□ 2.1
AMIGO1-201ENST00000369862 FERMT3Q86UX7 667 aa28.19■■■□□ 2.1
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