RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF5Q96JK2 942 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC1Q9NV70 894 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1BO43795 1136 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.22■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 RLBP1P12271 317 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SAMM50Q9Y512 469 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K5Q99683 1374 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE9O95405 1425 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 F13A1P00488 732 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 GCP02774 474 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.21■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 PRC1O43663 620 aa23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1B10O60218 316 aa23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.2■■□□□ 1.31
CCSAP-203ENST00000366687 GNAT2P19087 354 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 UBASH3AP57075 661 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 USP48Q86UV5 1035 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 HOOK3Q86VS8 718 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 DACT1Q9NYF0 836 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 SPECC1Q5M775 1068 aa23.2■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf34Q49A92 452 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 GNG11P61952 73 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 TOM1O60784 492 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.19■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH4A6NGS2 130 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 LIG1P18858 919 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 STAT6P42226 847 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 KRT24Q2M2I5 525 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 SIRT1Q96EB6 747 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 TNNQ9UQP3 1299 aa23.18■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM75PA6NK02 468 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CALM1P0DP23 149 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CALM2P0DP24 149 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CALM3P0DP25 149 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 NYXQ9GZU5 481 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 RAD50Q92878 1312 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 AFMP43652 599 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC172P0C7W6 258 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG5Q96R06 1193 aa23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.33e-7■□□□□ 9.3
CCSAP-203ENST00000366687 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CTNNA2P26232 953 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CALML3P27482 149 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PP64 1363 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA7O14818 248 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC174Q6PII3 467 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 SPTLC2O15270 562 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 MYZAPP0CAP1 466 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 GOPCQ9HD26 462 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 IP6K1Q92551 441 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 OGFOD1Q8N543 542 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 TMX1Q9H3N1 280 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 JADE2Q9NQC1 790 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-203ENST00000366687 PLCG2P16885 1265 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-203ENST00000366687 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms